全书多为诗词，其中有不少是关于秦川、磻溪、龙门、虢县、渭南等地风景名胜的纪实与即景抒情者。内容大致如下：一，苦心修炼。认为只有“身心百炼，炼出寸心如铁，才能“把旧习般般从头磨彻”。为弘扬“全真精神”，以重阳风范自勉，“十年苦志忘高卧”，“十载潜看万卷真”。平时蓬头垢面，顶笠披蓑(人称“蓑衣先生”)，放旷山林，逍遥云水，“虚堂任曲肱，展足和衣寝”。自谓居西虢六年，从无一件新衣履，每逢中秋，专事补缀。曾令人持诗去虢县换布缀衣。又不置箪瓢，沿村乞讨，不管冷热残余，只求“填肠塞肚”。 《岁寒守志》一诗，更描写其三冬独坐，朔风穿户、败衲重披，冻手频呵，饥寒交迫之窘况。自甘如此苦行，是早期全真道士的信条，以为只有如此，才能获得真功真行。二，研读三教经书。认为三教同源一理，诗云：“儒释道源三教祖，由来千圣古今同。”故兼修三教经书。对佛学禅理有相当造诣，文集中，“色身”、“法身”、“六根”、“圆觉”、“法轮”等词屡见不鲜。尤以儒学根底较深，曾云：“一阴一阳之谓道，太过不及俱失中。”待人应世，强调“愍物恻隐”、“慈悲为怀”，主张修阴德，免灾祸。并以“满口齿先落，终身舌未伤”，譬喻“柔弱胜刚强”，从而指出：学道修真，须以“挫刚锐”为“下手根基”。
三，积极进行斋醮活动。自大定二十八年，金世宗令作高功法师主万春节醮后，参加了无数次斋醮活动。明昌五年(1194)于福山县建醮，并传箓授戒。承安四年(1199)、大安元年(1209)又分别于登州修真观和胶西建醮。又相继赴蓬莱狄氏醮、潍州北海醮、虢县朝真醮等。他在“昌阳黄箓醮”中写道：“华灯羽服罗三殿，绛节霓旌下九霄。法事升坛千众集，香云结盖万神朝。从兹降福穰穰满，一县潜推百祸消。”又规劝道友： “幸遇门庭开教化，临逢斋醮莫推辞”。
四，广泛交往。邱处机不仅以诗文与诸秀才就学道、修行事相答问，还常以“劝道”、 “乐道”事与达官如定海军、蓬莱州、圣州等地节度使相咏和。在《答京兆统军夹谷龙虎书召》诗中云：“休休道者方归去，赫赫王侯又到来，自愧中心无道术，空教外迹播尘埃。”
综上所述，《磻溪集》是研究邱处机在磻溪、龙门修道时期的思想与活动的重要资料。
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