该书首列“清微道宗”、“上清启图”、“灵宝宗旨”、“道德正宗”、“正一渊源”等目，叙述清微派的渊源，末列“会道”，叙述清微派的传系。“清微道宗”列元始上帝递传玉宸道君、清微真元妙化天帝、九天妙道真运元君，……“上清启图”列上清高圣玉宸大道君递传紫宸太华大天帝、金阙帝宸太平后圣玄元上道君，……“灵宝宗旨”列玉晨道君灵宝天尊递传太玄玄一真人，太玄玄二真人，……“道德正宗”列金阙玄元老君道德天尊递传文始先生关令真人，太玄真人赵隆……“正一渊源”列太上玄元老君递传三天圣师泰玄上相正一真君张道陵，嗣师张衡，……以上所列传授谱系，事属谬悠，显为标榜其教渊源之古远。陈采在自序中对此渊源概括为：清微派之传，“始于元始，二之为玉晨与老君，又再一传，衍而为真元、太华、关令、正一之四派。”按此意，上列四目之传系即此四派之传系。但所云派名“真元”、“太华”不知何据。不过，既然出于虚构，也就不需再费稽考。最后“会道”一目，叙清微派之传授系统，称上述四派“十传至昭凝祖元君，又复合于一。”谓“元君祖舒，一名遂道，字昉仲，月孛化身，降唐昭宗时，广西零陵郡人”。此后递传郭玉隆(宋京师人)、傅央焴(字子方，酆州人)、姚庄(字淑奇，西京人)、高奭(燕人)、华英(凤翔府人)、朱洞元(成都人)、李少微(房州人)。“继是八传至混隐真人南公”即第九代南毕道(本复姓东南，名珪，1196～？，眉山人)，时当南宋理宗朝。南毕道原官广西宪司，其幕僚黄某(福建建宁人)之子舜申(字晦伯，1224～？)得疾，南毕道治愈之，并授之以雷法，遂为清微派第十代宗师。黄舜申在宝祐中(1253～1258)曾出为检阅，以擅长雷法闻名京师，皇兄赵孟端曾从其学，宋理宗亦召见，御书“雷渊真人”四字赠之。至元丙戌(1286)诏赴阙，未几乞还乡里，隐于紫霞湖沧州之上，元室曾敕授“雷渊广福普化真人”号。黄舜申为清微法之集大成者，《清微仙谱》序称，清微经法经其“覃思著述，阐扬宗旨，而其书始大备”。
以上所记之清微派传系，称起于祖舒，因无他书之参证，已难断其真伪；其后八传，也因资料缺乏，难于稽考。大致在南毕道以后，清微派始显传于世。黄舜申更有详细传记(载《历世真仙体道通鉴续编》卷五)叙其传教收徒事。
据《四库全书总目提要》载，谱后还附有《道迹灵仙记》《上清后圣道君列记》 《洞元灵宝三师记》各一卷。今《正统道藏》本概不复存，唯谱前有陈采自序一篇。此书是研究清微派教史的重要著作。
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